一个国际研究小组将精度达93.7％的橡胶树基因组草图绘出
发布时间：2016-07-12 15:05:02 人浏览
来源： 橡胶技术网
日本理化学研究所的一个国际研究小组成功绘制出精度达93.7％的橡胶树基因组草图。
该研究小组对东南亚广泛栽种的帕拉橡胶树品种“PRIM600”进行了基因组测序。他们首先利用约100个碱基短序列信息以99％以上精度进行解读的“Illumina”方法，与7000个碱基长序列信息以85％精度解读的“PacBio”方法组合，解读出高于预想基因155倍的信息量，获得了1.55Gb的橡胶树基因组草图。然后，对获得的基因组草图进行了基因组注释，预测出约84000个遗传基因，包含全部93.7％以上的遗传基因信息。研究小组利用“CAGE法”对帕拉橡胶树的叶、茎和胶乳进行RNA检测，发现了全遗传基因的基因表达量和转录起始部位。结果显示，与叶、茎相比，胶乳的天然橡胶相关基因高出100倍以上。
胶乳是脂质和蛋白质组成的称为“橡胶粒子”的乳白色小分子悬浮液。研究发现，橡胶粒子的蛋白质基因在染色体组上，形成了在转录的相同方向排列的基因簇。在获得帕拉橡胶树遗传基因信息的基础上，研究小组对各种橡胶树育种系统重新测序，得到了品种间差异的详细信息。
天然橡胶广泛应用于汽车、飞机轮胎及医疗领域。由于天然橡胶具有耐磨损和抗冲击的特点，随着相关产业的发展，对天然橡胶的需求越来越大。现在世界上约90％以上的天然橡胶产自东南亚，帕拉橡胶树经品种改良后产量有所提高，但与优良树种的杂交改良需要丰富的经验和较长的时间。橡胶树基因草图的绘制成功，对开发生产更具优良特性的天然橡胶产品有重要意义。
相关研究成果发表在最新一期的《科学报告》上。
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